船舶防污染实验室建成于2010年。现有LZY型油水分离器、OG120C型焚烧炉、CSWA型船舶生活污水处理装置、AGFU型海水淡化装置等设备。设备总资产约85万元，实验室占地面积约70㎡。

实验室主要承担轮机专业船舶防污染课程相关的实践教学。实验室开设《油水分离器操作实验》、《焚烧炉运行实验》等课程实验和综合操作训练实践教学项目。教学和训练对象是轮机专业本科学生和社会船员。实验室通过相关操作实践训练，引导学生独立开展操作实验，着力培养学生观察分析能力和动手实践能力，帮助学生加深巩固对所学知识的理解，培养严谨的工作态度与深刻的海洋防污染环保意识。