学院拥有船舶与海洋工程博士后科研流动站、船舶与海洋工程一级学科博士学位授权点、机械硕士专业学位授权点、能源动力硕士电气工程领域专业学位授权点、船舶与海洋工程同等学力硕士点。“船舶与海洋工程”学科为福建省特色重点学科、福建省一流建设学科。

学院根据海洋强国战略省市相关部署，以省级重点实验室、工程研究中心、协同创新中心、创新研究院等为基础的科技创新平台体系，从船舶与海工装备全寿命周期绿色智能化视角，重点引导学生参与解决船舶与海工装备设计与检测、船舶绿色动力技术、智能船舶及其运行关键技术、海洋功能材料与集成应用等亟需解决关键科学问题并突破相关关键核心技术，促进福建省船舶与海洋工程装备的特色发展和研发升级，提升我国船舶与海洋工程装备关键技术自主化水平。

学院拥有“福建省船舶与海洋工程重点实验室”、“福建省近海小型绿色智能船舶系统工程研究中心”、“数字福建卫星通信与海洋监测物联网实验室”、“福建省海工装备检测与再制造技术重大研发平台”、福建省海洋装备智能化与高性能制造协同创新中心”、“福建游艇产业共性关键技术协同创新中心”、 “福建省高校船舶与海洋工程工程技术中心”、“厦门市海洋腐蚀与智能防护材料重点实验室”、“福建省船舶行业技术开发基地”、“福建省船舶与海洋工程领域研究生教育创新基地”、“福建省船舶与海洋工程领域专业学位研究生联合培养示范基地”等科研、学术交流以及创新实践教育平台，近年来在科学研究和社会服务方面取得了可喜的成绩。